El .NET Scripting Backend está utilizando el poder de scripting de .NET de Microsoft. A diferencia de otras plataformas de Unity, Windows Store no está utilizando las librerías de perfil de la clase .NET 3.5, sino un subconjunto de .NET 4.5. Esto en gran medida es por requerimientos de certificación de la Windows Store. Esto significa que la plataforma tiene algunas incompatibilidades comparado a otras plataformas, tal como modelos plugin diferentes y algunos tipos que falten que están presentes en el perfil .NET 3.5 que Unity normalmente utiliza.